https://www.bigdick.live • 这是Web Feed，又称为Atom Feed，把现在的网址复制到新闻阅读器即可订阅本站文章。造访「About Feeds」来了解更多资讯。 造访网站 近期文章 更新于 $DATE date 数据可视化 孙瑜的个人首页：生物信息、数据科学、软件工程，以及公开简历、项目和文章。 Zola2018-09-01T00:00:00+00:00https://www.bigdick.live/tags/shu-ju-ke-shi-hua/atom.xml 2018-09-01T00:00:00+00:00 2018-09-01T00:00:00+00:00 孙瑜 https://www.bigdick.live/blog/circosan-zhuang-zh/ <p>之前听很多人吐槽说安装Circos费劲，各种Perl库装不上，装上了又找不到，今天让我来为大家介绍正确的体位：</p> <p>下载/解压Circos，并将其主程序添加到<code>$PATH</code>之后，是可以使用<code>circos -modules</code>来自动检查其perl依赖是否满足的，其输出大概为这样：</p> <pre class="giallo z-code"><code data-lang="plain"><span class="giallo-l"><span>ok 1.50 Carp</span></span> <span class="giallo-l"><span>ok 0.39 Clone</span></span> <span class="giallo-l"><span>missing Config::General</span></span> <span class="giallo-l"><span>ok 3.74 Cwd</span></span> <span class="giallo-l"><span>ok 2.170 Data::Dumper</span></span> <span class="giallo-l"><span>... (此处省略65536字hhhhh)</span></span></code></pre> <p>好的！不要慌！先<code>su</code>一下切到管理员账户下，然后<code>echo 'yes' | cpan App::cpanminus</code>把cpanm装上。什么？你不是管理员？那你喊狗管理帮你装Circos不就好了…</p> <p>然后<code>exit</code>回到自己的用户下，<code>circos -modules | perl -anE'print qq{$F[1] } if /^miss/ }{ say' | cpanm</code>，然后去泡个茶。</p> <p>回来你会吃了一精，所有缺少的模块都装好了。再运行<code>circos -modules</code>看看…嗯？还是都是miss？没关系，是@INC缓存没更新的缘故。去一个新的tty试一下，一切正常。</p> <p>好，这样成功解决了Circos的棘手的安装问题。祝各位生活性福美满。</p>